福建船政交通职业学院学校溯源
学校前身为创办于1866年的中国近代官办第一所高等实业学堂——福建船政学堂。
求是堂艺局
船政工程于1866年12月23日（同治五年十一月十七日）全面动工，求是堂艺局同时开局招生， 招收105人。堂址乃于城内暂设两处：定光寺（又称白塔寺）与仙塔街；城外分设亚伯尔顺洋房一处。1867年1月6日开学。学制初定5年，实际为7年。
学校于1867年6月6日迁至马尾新校舍，按其前、后位置，分为前、后学堂。
前学堂
1867年，仲夏，在马江之畔、中岐山之麓建起了中国第一所科技型高等学府——船政前、后学堂 ，培养高级造船、轮机制造和航海人才。6月8日开始上课。前学堂习法文，学制造，亦称制造学堂。
1876年3月9日，前学堂增设电报专业，又称电气学塾或电报学堂，招收32人。是中国第一所电报学校。
1913年10月，前学堂改名为福州海军制造学校。 学制延长到10年。
后学堂
后学堂习英文，学驾驶，亦称驾驶学堂。
1868年2月，增设管轮学堂，故亦称驾驶管轮学堂。 堂课5年，舰课2年。
1913年10月，后学堂改名为福州海军学校。 学制改为8年4个月。1926年5月，海军制造学校与海军飞潜学校并入海军学校。
1925年7月，增设化学专业，培养弹药检验人员，学制3年。
1926年5月，海军制造学校与海军飞潜学校并入海军学校。
1937年7月7日，日寇入侵。9月，海军学校迁鼔山涌泉寺上课。
1938年6月25日，由鼔山内迁湖南湘潭。10月，海军学校由湘潭再迁贵州桐梓（史称桐梓海校）。
1945年12月，迁贵州桐梓的马尾海军学校迁往重庆山洞。
1946年12月，迁至南京下关，与上海中央海军军官学校合并为青岛海军军官学校。
绘事院
1867年12月26日，设立绘事院，招生39人学制图、绘算概要等。学制三年，培养中级测绘人才。优秀生可升入前学堂。
艺圃
1868年2月17日，设立 ，又称艺徒学堂。招收艺徒100多人，学制5年，培养中级造船工人。
1897年4月，艺圃分为艺徒学堂和匠首学堂，学制分别为三年。艺徒择优升入匠首，培养高级技工 （技师）。优秀者可任监工（工程师）。
1913年10月，艺圃改名为福州海军艺术学校。
1935年2月，海军艺术学校停办，筹办“福建省马江私立勤工初级机械科职业学校”（简称勤工学校）。8月省教育厅准海军艺术学校 改为私立勤工学校。
1937年5月，省教育厅准勤工学校设立高级机械科和高级航空机械科，招收高小毕业生，学制5年。校名改为：福建省马江私立勤工工业职业学校。
1937年7月7日，日寇入侵。9月3日勤工学校迁鼔山下院上课。1938年6月10日内迁尤溪县。6月12日马尾勤工学校内的三个实验室被日寇炸毁。
1941年6月，勤工学校迁至将乐高滩。
1943年7月，受省交通局委托，代办汽车机械科，招收41人，学制为高中3年制。
1944年2月，勤工学校受省教育厅委托办“福建省立林森高级商船职业学校”（简称商船学校），一个班子，两面牌子。
1945年9月，抗战胜利后迁回马尾，两校合并， 改称：福建省立林森高级航空机械商船学校（简称高航）。
1949年9月，新中国成立后称：福建省立高级航空机械商船学校。
1952年8月，全国院系调整，高航停办；当年秋，航海专业并入国立福建航海专科学校，航机、轮机、造船专业并入福建省福州工业学校（福州工业学校造船专业1953年并入上海船舶工业学校）。
福建船政交通职业学院复校创办
福建船政学校
1981年5月1日，勤工、商船、高航三校校友在榕集会，庆祝校庆。推举五校友向省领导建议复办福建马尾商船学校。
1982年5月，省政府批准复办，10月6日福建马尾商船学校开学，省长参加开学典礼。
1988年5月，改为福建船政学校。1994年9月迁入仓山首山路办学。
福建交通职业技术学院
1994年，福建船政学校搬迁至仓山，后合并到福建交通职业技术学院。
1999年，由原福建交通学校、福建船政学校、福建交通干部学校、福建省公路技工学校四所学校合并升格而成。
2006年12月，被教育部、财政部确定为全国首批28所“国家示范性高等职业院校”建设单位之一。
2009年12月，顺利通过了教育部和财政部组织的“国家示范性高等职业院校”项目验收。
福建船政交通职业学院
2011年6月28日，福建交通职业技术学院更名为福建船政交通职业学院。
2016年8月，入选第二批国家现代学徒制试点单位。
2019年7月，被教育部认定为国家优质专科高等职业院校。
2019年10月，通过教育部现代学徒制第二批试点单位验收。
2019年12月，被教育部、财政部列入第三类高水平学校建设单位（c档）。